Биотин обладает высокой аффинностью к авидину и стрептавидину. В связи с этим, биотинилированные олигонуклеотиды находят широкое применение в таких областях как:

• in-situ гибридизация;
• саузерн-блоттинг;
• хемилюминесцентное секвенирование;
• анализ точечных мутаций;
• защита 3'-конца олигонуклеотида;
• генотипирование
• клонирование неизвестных последовательностей ДНК;
• иммобилизация на твердых носителях.

Биотин водится как на 5'-, так и на 3'-конец олигонуклеотида непосредственно в процессе синтеза. Очистка биотинилированных олигонуклеотидов осуществляется методом обращенно-фазовой ВЭЖХ или методом электрофореза в полиакриламидном геле. Гарантированный минимальный выход после очистки на шкале синтеза 250 нмоль - 4 ОЕ (20 нмоль). Гарантированная чистота олигонуклеотида - не менее 95%.