Набор реагентов «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»


кат. № ООМ-135

Набор реагентов «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2» предназначен для качественного определения РНК коронавируса SARS-CoV-2 с помощью полимеразной цепной реакции в реальном времени с обратной транскрипцией (ОТ-ПЦР-РВ) и флуоресцентной детекцией в препаратах НК, выделенных из проб, полученных при взятии мазков со слизистой носо- и ротоглотки, мокроты, промывных вод бронхов, полученных при фибробронхоскопии (бронхоальвеолярный лаваж).

Диагностическая роль набора реагентов заключается в возможности его использования для этиологической диагностики тяжелой острой респираторной инфекции - COVID-19 с помощью МАНК при исследовании материала от больного (подозрительного на заболевание).

Набор состоит из:
  • комплекта реагентов для выделения РНК ручным способом и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System «М-Сорб-НК»;
  • комплекта реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа

Преимущества набора реагентов «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»

  • Анализ по двум генам и двойной контроль

    Набор реагентов использует преимущества мультиплексной ОТ-ПЦР-РВ, а именно: одновременное выявление в одной пробе двух фрагментов РНК коронавируса SARS-CoV-2 (гены orf1ab и N), а также двух контрольных реакций Внутреннего Положительного Контроля по разным каналам детекции флуоресценции.

    Выявление РНК SARS-CoV-2 по двум специфическим фрагментам (каналы детекции R6G и ROX) позволяет обеспечить достоверную и надежную диагностику любых штаммов SARS-CoV-2, в том числе новых вариантов: британского –Alpha (B.1.1.7); южноафриканского – Beta (B.1.351); бразильского – Gamma (Р.1); индийского – Delta (B.1.617.2) и др.

    Наличие двух контрольных реакций Внутреннего Положительного Контроля позволяет оценить:
    - эффективность выделения нуклеиновых кислот (канал детекции FAM);
    - степень ингибирования реакции обратной транскрипции и амплификации (канал детекции Cy5);
    - исключить ложноотрицательные результаты анализа.

  • Обратная транскрипция и ПЦР-РВ – в одной пробирке

    Обнаружение фрагментов нуклеиновых кислот коронавируса SARS-CoV-2 реализовано методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ) в одной микропробирке, что позволяет уменьшить количество манипуляций с реакционной смесью и тем самым максимально снизить количество ошибок и возможность контаминации при постановке ОТ-ПЦР-РВ.

  • Наличие различных форматов для удобства пользователей:
    - нераскапанный формат;
    - готовая к использованию лиофилизованная реакционная смесь, расфасованная в стрипованные ПЦР-пробирки (жёсткие или гибкие) или ПЦР-плашки.

    Лиофилизированный формат позволяет транспортировать наборы реагентов при комнатной температуре (без соблюдения «холодовой цепи») и хранить их при температуре от плюс 2°С до плюс 8°С.

Формы выпуска набора «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»

Набор реагентов выпускается в 4 формах:

  • Форма выпуска 1 включает комплект реагентов для выделения РНК ручным способом и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System «М-Сорб-НК», комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2».
  • Форма выпуска 2 включает комплект реагентов для выделения РНК ручным способом и на автоматизированных станциях KingFisher Flex System «М-Сорб-НК», комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2-Л».
  • Форма выпуска 3 включает комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2».
  • Форма выпуска 4 включает комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2-Л».

Формы выпуска 1 и 2 предназначены для проведения полного ПЦР-исследования, включающего экстракцию РНК из клинического материала методом сорбции на магнитных частицах и амплификацию РНК методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ).

Формы выпуска 3 и 4 предназначены для проведения амплификации РНК методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ). Для проведения полного ПЦР-исследования с использованием форм выпуска 3 и 4 необходимо использовать комплект реагентов для экстракции РНК (например, «РИБО-преп», ФСР 2008/03147).

Комплект реагентов для выделения РНК ручным способом и на автоматизированных станциях «М-Сорб-НК»
Кат. №ООМ-500Л2-96
Отличительные характеристики
  • сорбция на магнитных частицах;
  • только одна промывка;
  • без этапа сушки сорбента перед элюцией
Способы выделения РНК
  • ручной;
  • на автоматизированных станциях:
    - ТЕСАN Freedom Evo;
    - KingFisher Flex System и аналоги
Время выделения РНК
  • при автоматическом выделении на KingFisher Flex System или аналогах не превышает 20 минут при загрузке 96 образцов;
  • при автоматическом выделении на ТЕСАN Freedom Evo 1,5-2 часа в зависимости от модификации станции;
  • при ручном выделении не превышает 50 минут при загрузке 24 образцов

Комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ анализа выпускается в вариантах исполнения для жидкой реакционной смеси и лиофилизированной: «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2» и «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2-Л» соответственно.

Комплект реагентов для проведения ОТ-ПЦР-РВ
Жидкая реакционная смесь «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»Лиофилизированная реакционная смесь
«ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2-Л»
Кат. №ООМ-135-96ООМ-135Л-96PООМ-135Л-96RGООМ-135Л-96S
Входит в составФорма выпуска 1
Форма выпуска 3
Форма выпуска 2
Форма выпуска 4
Форматнераскапанныйраскапанный, лиофилизированный
в планшетахв гибких стрипах, может использоваться для приборов RotorGene и для плашечных приборов CFX, DT, QS5, АНКв жестких стрипах, может использоваться для плашечных приборов CFX, DT, QS5, АНК

Аналитические характеристики «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»

  • Чувствительность

    Чувствительность – не более 1,0х103 копий РНК в миллилитре пробы (копий·мл-1) с воспроизводимостью не менее 97 %.

  • Специфичность

    Специфичность – ложноположительные результаты при анализе образцов НК респираторных инфекций: вирусы тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV), ближневосточного респираторного синдрома (MERS-CoV), гриппа типа А (H1N1, H3N2, H7N9, H5N1) и В, респираторно-синцитиальный вирус (РСВ), аденовирус 5 типа человека, риновирус человека, метапневмовирус человека, коронавирус человека, вирус парагриппа 1 типа, респираторный вирус человека, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae type B, отсутствовали.

Диагностические характеристики «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»

Эффективность выделения РНК ручным или автоматическим методом одинаковая; эффективность выявления вируса в вариантах исполнения лиофилизированной или жидкой реакционной смеси одинаковая.

Диагностическая специфичность (доля негативных результатов теста в группе отрицательных образцов) Интервал диагностической специфичности (с доверительной вероятностью 95%)* Диагностическая чувствительность (доля позитивных результатов теста в группе положительных образцов) Интервал диагностической чувствительности (с доверительной вероятностью 95%)**
100 % 96,97-100.00 % 100 % 96,23% -100.00 %

* – при исследовании 120 заведомо отрицательных образцов клинического материала определяемый по методу Клоппера и Пирсона

** – при исследовании 96 заведомо положительных образцов клинического материала определяемый по методу Клоппера и Пирсона

Ингибирующего влияния эндогенных (гемоглобин 200 мкг/мл, муцин 5%) и экзогенных (Хлоргексидин 0,5%, Стоматофит 1,5%, Мирамистин 0,001%, раствор Люголя с глицерином 0,5%) потенциально интерферирующих веществ на результат ОТ-ПЦР при исследовании образцов набором «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2» не обнаружено.

Постановка ОТ-ПЦР-РВ осуществляется на приборах для ПЦР-РВ, зарегистрированных в РФ как медицинское изделие и имеющих каналы детекции, соответствующие красителям FAM, R6G, ROX, Cy5 (либо их спектральным аналогам) – «АНК-32»/«АНК-М» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург), «CFX-96» (BioRad, США), «RotorGene» (Qiagen, Германия), «DTprime» («ДНК-Технология», Россия), «QuantStudio» (ThermoFisher Scientific, США).

Интерпретация результатов анализа проб с помощью набора реагентов «ОТ-ПЦР-РВ-SARS-CoV-2»

Кинетические кривые роста сигнала флуоресценции по каналам HEX, ROX, FAM, Cy5 – положительный результат на коронавирус SARS-CoV-2 (CFX-96)

Кинетические кривые роста сигнала флуоресценции по каналам HEX, ROX, FAM, Cy5 – отрицательный результат на коронавирус SARS-CoV-2 (CFX-96)


Вернуться в раздел