Набор реагентов «ПЦР‑РВ‑2019‑nCov»

кат. № ООМ-132

Description in englishManual in english

Набор реагентов «ПЦР-РВ-2019-nCov» предназначен для качественного определения (скрининг, мониторинг) РНК коронавируса SARS-CoV-2 в препаратах нуклеиновых кислот, выделенных из проб, полученных при взятии мазка из носа, носоглотки и/или ротоглотки, промывных вод бронхов, полученных при фибробронхоскопии (бронхоальвеолярныий лаваж), а также из (эндо)трахеального, назофарингеального аспирата, мокроты, биопсийного или аутопсийного материала легких, цельной крови, сыворотки, мочи.

Для выделения РНК рекомендуется использовать набор реагентов с известными характеристиками в отношении интерферентов, зарегистрированный в установленном порядке («РИБО-преп», ФСР 2008/03147), а также, в случае, если требования наличия регистрационного удостоверения не предъявляются, рекомендуется использовать набор «М-сорб-ООМ» (кат. № ООМ-502).

Преимущества набора реагентов «ПЦР-РВ-2019-nCov»

  • Набор реагентов использует преимущества мультиплексной ОТ-ПЦР-РВ, а именно: одновременное выявление в одной пробе РНК коронавируса SARS-CoV-2 (канал детекции R6G) и постановка двух контрольных реакций, исключающих ложноотрицательные результаты анализа:
    - реакции, позволяющей оценить эффективность выделения нуклеиновых кислот – ВПК-В-РНК (канал детекции FAM);
    - реакции, позволяющей оценить степень ингибирования реакции обратной транскрипции и амплификации – ВПК ОТ-ПЦР-РВ (канал детекции Cy5).
  • Готовая к использованию реакционная смесь, РС-nCoV, расфасована в стрипованные ПЦР-пробирки объемом 0,2 мл и лиофилизована. Данный формат позволяет транспортировать наборы реагентов при комнатной температуре и хранить их при температуре от плюс 2oС до плюс 8oС.
  • Обнаружение фрагментов нуклеиновых кислот коронавируса SARS-CoV-2 реализовано методом обратной транскрипции, совмещенной с полимеразной цепной реакцией в реальном времени (ОТ-ПЦР-РВ) в одной микропробирке, что позволяет уменьшить количество манипуляций с реакционной смесью и тем самым максимально снизить количество ошибок и возможность контаминации при постановке ОТ-ПЦР-РВ.

Аналитические характеристики «ПЦР-РВ-2019-nCov»

  • Чувствительность

    Не более 1,0х103 копий РНК в миллилитре пробы (копий·мл-1). Для достижения данного показателя рекомендуется использование наборов реагентов для выделения нуклеиновых кислот (НК), допускающих отбор аликвот исходного материала (проб) объемом не менее 100 мкл.

  • Специфичность

    Ложноположительные и ложноотрицательные результаты при анализе образцов НК респираторных инфекций: тяжелого острого респираторного синдрома (SARS-CoV), ближневосточного респираторного синдрома (MERS-Cov), гриппа типа А H1N1, H5N1 и В, респираторно-синцитиального вируса (РСВ), аденовирусов, Coxiella burnetii, Streptococcus pneumoniae, Haemophilus influenzae type B, Legionella pneumophila, Metapneumovirus, Human respirovirus 1, Rhinovirus (14 заведомо отрицательных образцов) отсутствовали.

При проведении исследований наблюдалась 100% внутрипостановочная, межпостановочная и межсерийная воспроизводимость для всех положительных образцов.

Диагностические характеристики «ПЦР-РВ-2019-nCov»

Клинические исследования набора проведены на базе ФБУН ГНЦ ВБ Вектор (р.п. Кольцово, Новосибирской области). Диагностические чувствительность и специфичность оценивались при анализе 160 проб образцов клинического материала, контаминированных штаммом вируса 2019-nCoV (SARS-CoV-2) в количестве 0,1 lg TCID50/мл (1*103 ГЭ/мл), а также 100 образцов клинического материала от пациентов с иной этиологией респираторного заболевания (грипп А и В, парагрипп, аденовирусная инфекция, респираторно-синцитиальная инфекция, метапневмовирусная инфекция, риновирусная инфекция и коронавирусная инфекция человека, вызванная hCov NL63, hCov OC43, hCov 229E, hCov HKUI), с использованием разных серий испытуемого набора на четырех разных амплификаторах.

Вид исследуемого материала Диагностическая чувствительность
(с доверительной вероятностью 95%)
Диагностическая специфичность
(с доверительной вероятностью 95%)
Мазки со слизистой носа, носоглотки и ротоглотки, бронхоальвеолярный лаважа/промывных вод бронхов, аспират эндотрахеальный и назофарингиальный, мокрота, аутопсийные образцы цельная кровь, сыворотка крови, моча 100%
(97.7% -100.00%)
100%
(96.5% -100.00%)

Результаты анализа 160 образцов клинического материала, контаминированных штаммом вируса 2019-nCoV (SARS-CoV-2) в количестве 0,1 lg TCID50/мл (1*103 ГЭ/мл), проанализированных при различных контролируемых переменных: на разных базах (лабораториях), двумя разными операторами, с использованием разных серий испытуемого набора, на четырех разных амплификаторах, полностью совпали. Воспроизводимость и повторяемость медицинского изделия составили 100%.

Постановка ОТ-ПЦР-РВ осуществляется на приборах для ПЦР в реальном времени, имеющих каналы детекции FAM, R6G (HEX, JOE), Cy5, например, «АНК-32», «АНК-М», «DTprime/DTlite», «CFX96», «Rotor-Gene Q/6000» и других, эквивалентных по характеристикам.

Пример результатов анализа на выявление РНК SARS-CoV-2 с использованием набора реагентов «ПЦР-РВ-2019-nCov» на приборе для ПЦР в реальном времени «CFX96» (Bio-Rad, США)

Интерпретация результатов анализа на выявление РНК SARS-CoV-2 с использованием набора реагентов «ПЦР-РВ-2019-nCov» на приборе «CFX96» (Bio-Rad, США)

Положительный контрольный образец, ПКО
Отрицательный контрольный образец, ОКО
Положительный результат анализа
на выявление SARS-CoV-2
Отрицательный результат анализа
на выявление SARS-CoV-2