Генетический анализатор «НАНОФОР 05»
Первый серийный отечественный секвенатор ДНК открытого типа.
- Открытый
- 7-цветный
- 8-капиллярный
- Комплектуется российскими реагентами
| Количество капилляров | 8 |
| Формат планшета | 96 х 0,2 мл |
| Количество каналов детекции флуоресценции | 7 |
| Лазер | твердотельный |
| Мощность лазера | 110 мВт |
| Длина волны лазера | 488 нм |
| Диапазон напряжения | 0,1 – 15 кВ |
| Диапазон и точность поддержания температуры | 30-70 °С (+/- 0,03 °С) |
| Длина прочтения с точностью не хуже 98,5% | до 750 нуклеотидов |
| Время стандартного фрагментного анализа до 460 нуклеотидов | 34 минуты |
| Максимальная анализируемая длина фрагмента ДНК (фрагментный анализ) | не менее 1200 нуклеотидов |
| Масса | не более 50 кг |
| Габариты, ШхГхВ | 630 х 600 х 630 мм |
| Потребляемая мощность | 300 Вт |
| Напряжение и частота сети | 190-240 В; 50-60 Гц |
| Требования к компьютеру | USB; Windows 10 |
| Требования к внешним условиям | температура 15-30°С, влажность 20-80 % |
| Открытость системы | да, полностью открытая система, позволяющая работать с реагентами других производителей |
| Программное обеспечение | русскоязычное |
| Возможность работы с программами других производителей | да, автоматическая конвертация данных в форматы .ab1, .fsa |
| Гарантийный срок обслуживания | 2 года |
- –Обучение секвенированию и фрагментному анализу в группах и индивидуально
- –Пуско-наладка оборудования
- –Консультации специалистов
- –Бесплатное обновление программного обеспечения
- –Быстрый и доступный по цене сервис
- –Разработка наборов реагентов под задачи заказчиков
- –Экономически выгодные отечественные реагенты
- –Приборы «резерва» для замены в экстренных случаях
- –Организация и проведение «круглых столов» для пользователей
В России и ближнем зарубежье работают несколько десятков приборов Нанофор 05
Нанофор 05 – оригинальная разработка российских учёных
Патент РФ № 2145078
Серийное производство в России с 2015 года
Компания «Синтол» выражает благодарность Министерству образования и науки РФ за финансовую поддержку при создании прибора Нанофор 05
| № | Название ПО | Функция |
|---|---|---|
| 1 | Программа управления прибором «Нанофор 05» | Позволяет с помощью готовых протоколов:
|
| 2 | Программа анализа последовательности ДНК «ДНК Анализ» | Проводит преобразование пиков сиквенсной реакционной смеси в последовательность ДНК. Автоматически конвертирует данные в формат *.ab1, что позволяет проводить аналогичный анализ в пакете Sequencing Analysis (ThermoFisher Scientific). |
| 3 | Программа фрагментного анализа ДНК «ДНК ФА» | Проводит анализ длин фрагментов ДНК с использованием различных стандартов длин, а также количества коротких тандемных повторов с использованием аллельных лестниц, панелей бинов и аллелей. Автоматически конвертирует данные в формат *.fsa , что позволяет проводить аналогичный анализ в пакетах GeneMapper (ThermoFisher Scientific), PeakScanner (ThermoFisher Scientific) и т.п. |
| 4 | Программа анализа и редактирования результатов секвенирования ДНК «ПАР²СЕК» | Предназначена для сравнительного анализа и редактирования последовательностей ДНК. |
| Наименование, значение | Нанофор 05 | 3500 Genetic Analyzer |
|---|---|---|
| Количество капилляров | 8 | 8 |
| Количество каналов детекции | 7 | 6 |
| Длина волны лазера, нм | 488 | 505 |
| Диапазон длин детекции флуоресценции, нм | 510 - 710 | 525 - 650 |
| Мощность лазера, мВт | 110 | 25 |
| Диапазон напряжения, кВ | 0,1 - 20 | 0,1 - 19 |
| Диапазон и точность поддержания температуры, °С | 30 - 70 (± 0,03) | 18 - 70 (± 1) |
| Возможность работы в неденатурирующих условиях | ДА | НЕТ |
| Открытость системы | ДА | НЕТ, RFID |
| Время готовности к работе после запуска, мин. | 5 | 30 |
| Вес, кг | 47 | 82 |
| Потребляемая мощность, Вт | 300 | 1000 |
| Габариты, Ш х Г х В, мм | 630 х 600 х 630 | 610 х 610 х 720 |
| Русскоязычное программное обеспечение | ДА | НЕТ |
| Гарантия | 2 года | 1 год |
Сравнение качества секвенирования в области 500-600 нуклеотидов приборов Нанофор 05 и 3500 Genetic Analyzer
Длина капилляров – 50 см,
Полимер – ПДМА-6,
Программа обработки данных –
«ДНК Анализ», версия.5.0.2.5
Длина капилляров – 50 см,
Полимер – POP7,
Программа обработки данных –
Sequencing Analysis, v.5.4
Криминалистика
Аллельные лестницы, полученные на приборе Нанофор 05 с помощью наборов ведущих производителей реагентов для криминалистики:
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Высокая воспроизводимость анализа на генетическом анализаторе Нанофор 05
Пренатальная диагностика
Электрофореграмма разделения продуктов амплификации исследуемой ДНК человека. Для локусов D21S1411 и IFNAR показано наличие трёх аллелей исследуемых маркеров. Выявлена трисомия по 21 хромосоме (синдром Дауна)
Электрофореграмма разделения продуктов амплификации исследуемой ДНК человека. Выявлена трисомия по половым хромосомам. Пол – XXY (синдром Клайнфельтера)
Диагностика наследственных заболеваний
Выявление мутаций, вызывающих синдром Ретта
Замена С>Т в положении p.R255X:
Делеция del C в положении p.G232 fs:
Выявление мутаций, вызывающих болезнь Паркинсона
Онкология
Диагностика наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям
Пример диагностики предрасположенности к раку молочной железы с использованием набора EasySeq PCR plates
for BRCA1 and BRCA2 screening (Nimagen).
Мутации в 9 экзоне гена BRCA1.
Оценка качества подготовленных библиотек для NGS
Пример успешной амплификации пула из 24 библиотек, проанализированного на приборе НАНОФОР 05 в неденатурирующих условиях. Оценка распределения библиотек по длине (неврологическая панель) для таргетного секвенирования. Пул библиотек находится в диапазоне 300-400 bp. Библиотеки приготовлены с использованием набора SeqCap EZ (Roche) и KAPA (Illumina).
Вернуться в раздел
