Генетический анализатор «НАНОФОР-05»


Первый серийный отечественный секвенатор ДНК открытого типа

  • Открытый
  • 7-цветный
  • 8-капиллярный
  • Комплектуется российскими реагентами
Технические и пользовательские характеристики
Количество капилляров8
Формат планшета96 х 0,2 мл
Количество каналов детекции флуоресценции7
Лазертвердотельный
Мощность лазера110 мВт
Длина волны лазера488 нм
Диапазон напряжения0,1 – 20 кВ
Диапазон и точность поддержания температуры30-70 °С (+/- 0,03 °С)
Длина прочтения с точностью не хуже 98,5%до 750 нуклеотидов
Время стандартного фрагментного анализа до 450 нуклеотидов25 минут
Максимальная анализируемая длина фрагмента ДНК (фрагментный анализ)не менее 1200 нуклеотидов
Массане более 50 кг
Габариты, ШхГхВ630 х 600 х 630 мм
Потребляемая мощность300 Вт
Напряжение и частота сети190-240 В; 50-60 Гц
Требования к компьютеруUSB; Windows 10
Требования к внешним условиямтемпература 15-30°С, влажность 20-80 %
Открытость системыда, полностью открытая система, позволяющая работать с реагентами других производителей
Программное обеспечениерусскоязычное
Возможность работы с программами других производителейда, автоматическая конвертация данных в форматы .ab1, .fsa
Гарантийный срок обслуживания2 года
Регистрационное удостоверение РосздравнадзораРУ № РЗН 2015/ 3474 от 28 декабря 2015 года
  • –Обучение секвенированию и фрагментному анализу в группах и индивидуально
  • –Пуско-наладка оборудования
  • –Консультации специалистов
  • –Бесплатное обновление программного обеспечения
  • –Быстрый и доступный по цене сервис
  • –Разработка наборов реагентов под задачи заказчиков
  • –Экономически выгодные отечественные реагенты
  • –Приборы «резерва» для замены в экстренных случаях
  • –Организация и проведение «круглых столов» для пользователей

В России и ближнем зарубежье работают несколько десятков приборов Нанофор 05

Нанофор 05 – оригинальная разработка российских учёных

Патент РФ № 2145078

Серийное производство в России с 2015 года

Компания «Синтол» выражает благодарность Министерству образования и науки РФ за финансовую поддержку при создании прибора Нанофор 05

Программное обеспечение прибора Нанофор 05
Название ПОФункция
1Программа управления прибором «Нанофор 05»Позволяет с помощью готовых протоколов:
    управлять прибором – проводить пространственную и спектральную калибровки,
  • электрофорез сиквенсных реакционных смесей, продуктов ПЦР и геномных библиотек;
  • проводить сервисное обслуживание – замену капилляров, замену полимера, удаление пузырей, консервацию и подготовку к работе.
2Программа анализа последовательности ДНК «ДНК Анализ»Проводит преобразование пиков сиквенсной реакционной смеси в последовательность ДНК. Автоматически конвертирует данные в формат *.ab1, что позволяет проводить аналогичный анализ в пакете Sequencing Analysis (ThermoFisher Scientific).
3Программа фрагментного анализа ДНК «ДНК ФА»Проводит анализ длин фрагментов ДНК с использованием различных стандартов длин, а также количества коротких тандемных повторов с использованием аллельных лестниц, панелей бинов и аллелей. Автоматически конвертирует данные в формат *.fsa , что позволяет проводить аналогичный анализ в пакетах GeneMapper (ThermoFisher Scientific), PeakScanner (ThermoFisher Scientific) и т.п.
4Программа анализа и редактирования результатов секвенирования ДНК «ПАР²СЕК»Предназначена для сравнительного анализа и редактирования последовательностей ДНК.
Сравнение технических и пользовательских характеристик приборов Нанофор 05 и 3500 Genetic Analyzer
Наименование, значениеНанофор 053500 Genetic Analyzer
Количество капилляров88
Количество каналов детекции76
Длина волны лазера, нм488505
Диапазон длин детекции флуоресценции, нм510 - 710525 - 650
Мощность лазера, мВт11025
Диапазон напряжения, кВ0,1 - 200,1 - 19
Диапазон и точность поддержания температуры, °С30 - 70 (± 0,03)18 - 70 (± 1)
Возможность работы в неденатурирующих условияхДАНЕТ
Открытость системыДАНЕТ, RFID
Время готовности к работе после запуска, мин.530
Вес, кг4782
Потребляемая мощность, Вт3001000
Габариты, Ш х Г х В, мм630 х 600 х 630610 х 610 х 720
Русскоязычное программное обеспечениеДАНЕТ
Гарантия2 года1 год

Сравнение качества секвенирования в области 500-600 нуклеотидов приборов Нанофор 05 и 3500 Genetic Analyzer

Прибор – Нанофор 05,
Длина капилляров – 50 см,
Полимер – ПДМА-6,
Программа обработки данных –
«ДНК Анализ», версия.5.0.2.5
Прибор – 3500 Genetic Analyzer
Длина капилляров – 50 см,
Полимер – POP7,
Программа обработки данных –
Sequencing Analysis, v.5.4

Криминалистика

Аллельные лестницы, полученные на приборе Нанофор 05 с помощью наборов ведущих производителей реагентов для криминалистики:

Аллельная лестница из набора COrDIS Expert v4, ООО «Гордиз» (Россия).
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Положительный контрольный образец из набора COrDIS Expert v4, ООО «Гордиз» (Россия)


Аллельная лестница из набора Investigator 24plex QS kit, Qiagen (Германия).
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Аллельная лестница из набора GlobalFiler PCR Amplification kit, Thermo Fisher Scientific (США).
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут
Аллельная лестница из набора PowerPlex Fusion 6C System, Promega (США).
Длина капилляров 36 см, полимер ПДМА-4, общее время анализа 8 образцов - 30 минут

Высокая воспроизводимость анализа на генетическом анализаторе Нанофор 05

Фрагмент наложения 5 аллельных лестниц из набора GlobalFiler PCR Amplification kit, ThermoFisher Scientific (США)

Пренатальная диагностика

Диагностика трисомий
Электрофореграмма разделения продуктов амплификации исследуемой ДНК человека. Для локусов D21S1411 и IFNAR показано наличие трёх аллелей исследуемых маркеров. Выявлена трисомия по 21 хромосоме (синдром Дауна)
Диагностика трисомий
Электрофореграмма разделения продуктов амплификации исследуемой ДНК человека. Выявлена трисомия по половым хромосомам. Пол – XXY (синдром Клайнфельтера)

Диагностика наследственных заболеваний

Выявление мутаций, вызывающих синдром Ретта
Замена С>Т в положении p.R255X:

электрофореграмма, полученная на генетическом анализаторе НАНОФОР 05
электрофореграмма, полученная на приборе ABI Prism 3130

Делеция del C в положении p.G232 fs:

электрофореграмма, полученная на генетическом анализаторе НАНОФОР 05
электрофореграмма, полученная на приборе ABI Prism 3130

Выявление мутаций, вызывающих болезнь Паркинсона

Электрофореграмма исследуемого образца, полученная с использованием набора SALSA MLPA P052-C2 (MRC Holland)

Онкология

Диагностика наследственной предрасположенности к онкологическим заболеваниям

Пример диагностики предрасположенности к раку молочной железы с использованием набора EasySeq PCR plates for BRCA1 and BRCA2 screening (Nimagen).
Мутации в 9 экзоне гена BRCA1.

Оценка качества подготовленных библиотек для NGS

Пример успешной амплификации пула из 24 библиотек, проанализированного на приборе НАНОФОР 05 в неденатурирующих условиях. Оценка распределения библиотек по длине (неврологическая панель) для таргетного секвенирования. Пул библиотек находится в диапазоне 300-400 bp. Библиотеки приготовлены с использованием набора SeqCap EZ (Roche) и KAPA (Illumina).


Вернуться в раздел