Набор реагентов "Acidovorax avenae subsp. avenae-РВ"

Кат. № PH-077

Acidovorax avenae subsp. avenae – грамотрицательная фитопатогенная бактерия, вызывающая бактериальные пятнистости и гнили у широкого круга злаковых культур, включая рис, кукурузу, пшеницу, овёс, просо и сахарный тростник. Заболевания, вызываемые этим патогеном, приводят к значительным потерям урожая (Willems et al., 1992; Schaad et al., 2001).

Вид был впервые описан как Pseudomonas avenae, однако позже переклассифицирован в род Acidovorax на основании фенотипических и молекулярно-генетических данных (Willems et al., 1992). Первоначально в составе вида выделяли несколько подвидов, включая A. avenae subsp. avenae, однако позднее таксономия группы была пересмотрена (Schaad et al., 2008). Патоген имеет широкое географическое распространение и был зарегистрирован как в тёплых влажных регионах, так и в умеренных широтах (Osdaghi E., 2023).

Acidovorax avenae subsp. avenae не включён в перечни карантинных вредных организмов EPPO A1 и A2, однако в базе данных для данного таксона указаны фитосанитарные статусы: A1 для Египта и статус карантинного вредного организма для Марокко. Кроме того, по данным анализа национальных фитосанитарных требований, A. avenae subsp. avenae регулируется в ряде стран, включая Гвинею, Египет, Израиль, Индию, Китай, Кубу, Малайзию, Мали, Мексику, Никарагуа, Судан, Тайвань и Эквадор.

Основными растениями-хозяевами являются представители семейства Poaceae, включая Oryza sativa, Zea mays, Triticum aestivum, Avena sativa, Saccharum spp. (Ji C. et al., 2014; Osdaghi et al., 2023). Некоторые дикорастущие злаки и декоративные культуры, например Strelitzia nicolai, могут выступать промежуточными или альтернативными хозяевами патогена (Seijo et al., 2011).

Основным источником заражения служат инфицированные семена и растительные остатки, в которых бактерия сохраняется в течение длительного времени. Распространение происходит с каплями воды (дождь, орошение), а также механически при агротехнических операциях. Инфекция проникает через устьица, гидатоды или повреждения тканей. Развитие болезни наиболее активно при высокой влажности и температуре 25–35°C. Сроки появления симптомов варьируют от нескольких дней до нескольких недель и зависят от культуры-хозяина, фазы развития растения, инфекционной нагрузки и условий среды. (Osdaghi, 2023; Schaad et al., 1980).

Основные симптомы поражения растений A. avenae проявляются в виде водянистых пятен на листьях, которые со временем становятся некротическими, удлинёнными, часто с хлорозной каймой. У риса наблюдается бактериальная полосатость и увядание проростков (бактериальная гниль всходов), у кукурузы – полосчатая пятнистость и некрозы листьев. При сильном поражении происходит угнетение роста растений, снижение продуктивности и гибель всходов. На поздних стадиях возможно развитие системной инфекции, приводящей к гибели растений (Kadota, Ohuchi, 1990; Ji et al., 2014).

«Acidovorax avenae subsp. avenae - РВ»

Набор реагентов для выявления ДНК Acidovorax avenae subsp. avenae, возбудителя бактериальной полосатости и ожога листьев злаков методом полимеразной цепной реакции в реальном времени

Набор может быть использован в лабораторных центрах и институтах, проводящих контроль фитосанитарного состояния растений, в том числе посадочного материала в целях обнаружения Acidovorax avenae subsp. avenae. Набор позволяет качественно определить, наличие в образце ДНК Acidovorax avenae subsp. avenae.

Набор реагентов «Acidovorax avenae subsp. avenae - РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный для возбудителя бактериальной полосатости и ожога листьев злаков фрагмент гена по каналу флуоресценции FAM/Green, а также внутренний положительный контроль (ВПК) по каналу флуоресценции R6G/HEX/Yellow/VIC.

  • Чувствительность

    Чувствительность ПЦР при использовании набора реагентов «Acidovorax avenae subsp. avenae - РВ» – не менее 2,0*103 копий ДНК в миллилитре пробы.

  • Специфичность

    Специфичность – ложноотрицательные результаты при анализе образцов, содержащих ДНК целевого объекта, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов ДНК, не содержащих вышеперечисленные специфические фрагменты, отсутствовали.

Литература:

  • 1. EPPO Global Database. Acidovorax avenae (PSDMAV).
  • 2. Ji C. et al. First report of corn bacterial leaf stripe caused by Acidovorax avenae in Guangdong Province, China //Plant Disease. – 2014. – Т. 98. – №. 10. – С. 1424-1424.
  • 3. Kadota I., Ohuchi A. Symptoms and ecology of bacterial brown stripe of rice //Japan Agricultural Research Quarterly. – 1990. – Т. 24. – №. 1. – С. 15-21.
  • 4. Osdaghi E. Acidovorax avenae (bacterial leaf blight of grasses) [Электронный ресурс] // CABI Compendium. 2023. DOI: 10.1079/cabicompendium.44935. URL: https://www.cabidigitallibrary.org/doi/full/10.1079/cabicompendium.44935 (дата обращения: 17.06.2026).
  • 5. Schaad N.W., Sumner D.R., Ware G.O. Influence of temperature and light on severity of bacterial blight of corn, oats, and wheat // Plant Disease. 1980. Vol. 64. No. 5. P. 481–483. DOI: 10.1094/PD-64-481.
  • 6. Schaad N. W., Jones J. B., Chun W. Laboratory guide for the identification of plant pathogenic bacteria. – 2001.
  • 7. Schaad N. W. et al. Reclassification of subspecies of Acidovorax avenae as A. Avenae (Manns 1905) emend., A. cattleyae (Pavarino, 1911) comb. nov., A. citrulli Schaad et al., 1978) comb. nov., and proposal of A. oryzae sp. nov //Systematic and applied microbiology. – 2008. – Т. 31. – №. 6-8. – С. 434-446.
  • 8. Seijo T. E., Peres N. A. First report of Acidovorax avenae subsp. avenae causing bacterial leaf stripe of Strelitzia nicolai //Plant Disease. – 2011. – Т. 95. – №. 11. – С. 1474-1474.
  • 9. Willems A. et al. Transfer of several phytopathogenic Pseudomonas species to Acidovorax as Acidovorax avenae subsp. avenae subsp. nov., comb. nov., Acidovorax avenae subsp. citrulli, Acidovorax avenae subsp. cattleyae, and Acidovorax konjaci //International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology. – 1992. – Т. 42. – №. 1. – С. 107-119.
  • 10. Xie G.L. et al. Genome sequence of the rice-pathogenic bacterium Acidovorax avenae subsp. avenae RS-1. – 2011.

Набор реагентов апробирован на следующих приборах: Gentier 96Е (Tianlong, Китай), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США), «CFX96» («BioRad», США), «DT» («ДНК-технология», Россия), «Rotor Gene» (Qiagen), «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия)

Пример анализа «CFX96»

Набор реагентов "Acidovorax avenae subsp. avenae-РВ" - Пример анализа «CFX96»

Пример анализа «Rotor Gene Q»

Набор реагентов "Acidovorax avenae subsp. avenae-РВ" - Пример анализа «Rotor Gene Q»

Пример анализа «DTprime»

Набор реагентов "Acidovorax avenae subsp. avenae-РВ" - Пример анализа «DTprime»

Пример анализа «QuantStudio 5»

Набор реагентов "Acidovorax avenae subsp. avenae-РВ" - Пример анализа «QuantStudio 5»

Пример анализа «Gentier 96Е»

Набор реагентов "Acidovorax avenae subsp. avenae-РВ" - Пример анализа «Gentier 96Е»
...

Вернуться в раздел