Набор реагентов "Hop stunt viroid-РВ"
Кат. № PH-078
Hop stunt viroid (HSVd) — вироид карликовости хмеля, типовой вид рода Hostuviroid семейства Pospiviroidae (Puchta et al. 1988). Геном HSVd представляет собой кольцевую одноцепочечную молекулу РНК длиной 295–303 нуклеотида в зависимости от изолята и варианта последовательности. В отличие от ряда других представителей семейства Pospiviroidae, HSVd не содержит терминальной консервативной области (TCR), однако имеет терминальную консервативную шпильку (TCH).
HSVd впервые был связан с заболеванием хмеля в Японии. В настоящее время вироид имеет мировое распространение и характеризуется широким кругом растений-хозяев. Он выявлен, в частности, у представителей родов Citrus, Cucumis, Ficus, Fortunella, а также у Humulus lupulus L., Fragaria × ananassa, Hibiscus rosa-sinensis L., Luffa aegyptiaca Mill. и ряда других растений.
Передача HSVd может происходить механически, в том числе с использованием загрязненного инструмента, а также при вегетативном размножении и прививке. Для ряда растений инфекция может протекать бессимптомно, тогда как у восприимчивых хозяев HSVd способен вызывать специфические заболевания. К числу описанных проявлений относятся карликовость хмеля, бледность плодов огурца, кахексия цитрусовых, а также пятнистость и деформация плодов у некоторых представителей рода Prunus.
«Hop stunt viroid - РВ»
Набор реагентов для выявления РНК вироида карликовости хмеля методом полимеразной цепной реакции в реальном времени совмещенной с реакцией обратной транскрипции «Hop stunt viroid - РВ».
Набор может быть использован в лабораторных центрах и институтах, проводящих контроль фитосанитарного состояния растений, в том числе посадочного материала в целях обнаружения Hop stunt viroid. Набор позволяет качественно определить, наличие в образце РНК Hop stunt viroid.
Набор реагентов «Hop stunt viroid – РВ» позволяет одновременно выявлять в одной реакционной смеси специфичный фрагмент РНК Hop stunt viroid – по каналу флуоресценции FAM/Green, а также внутренний положительный контроль (ВПК) – по каналу флуоресценции R6G/HEX/Yellow/VIC. Реакция ВПК необходима для исключения ложноотрицательных результатов.
- Чувствительность
Чувствительность ПЦР при использовании набора реагентов «Hop stunt viroid - РВ»— 2,0*103 копий кДНК в миллилитре пробы
- Специфичность
Специфичность – ложноотрицательные результаты при анализе образцов, содержащих РНК целевого объекта, отсутствовали, ложноположительные результаты при анализе образцов РНК, не содержащих вышеперечисленные специфические фрагменты, отсутствовали.
Набор реагентов апробирован на следующих приборах: Gentier 96Е (Tianlong, Китай), QuantStudio 5 (Thermo Fisher Scientific, США), «CFX96» («BioRad», США), «DT» («ДНК-технология», Россия), «Rotor Gene» (Qiagen), «АНК-32 (32М, 48)» (ИАП РАН, г. Санкт-Петербург, Россия)
Вернуться в раздел